L2 Interface Biologie - Chimie

Cette UE libre est ouverte aux étudiants qui souhaitent suivre un enseignement optionnel supplémentaire (sous réserve de compatibilité des emplois du temps et après accord des responsables de formation) et/ou réaliser un stage facultatif conventionné.
NB : Cette UE est non diplômante, c’est à dire que sa validation ne peut pas servir à l’obtention des 60 ECTS nécessaires à la validation de l’année

OAV : Acquérir un complément de formation.

Modalités de contrôle des connaissances et compétences (MC2C) :

Si l’étudiant s’inscrit dans cette UE dans le but de suivre une UE optionnelle supplémentaire, la validation de l’UE suivra les MC2C de l’UE en question. Si l’étudiant s’inscrit dans cette UE dans le but de réaliser un stage facultatif conventionné, il conviendra avec son enseignant référent des modalités de suivi et d’évaluation. Cette évaluation ne fera pas l’objet d’une note, le résultat sera « acquis » ou « non acquis ».

Cette UE est disponible sous forme de ressources numériques avec une partie de présentiel :

l’équivalent de 18h de cours/td sous forme de ressources numériques (vidéos, ppt, pdf,…) 2 fois 1h30 d’amphi débat retransmis en streaming sur un thème 2 fois 1h30 de TD sur un thème

Le plan est le suivant :
I- Causes anthropiques des changements globaux : évolution de la place de l'être humain dans la nature
II- Érosion de la biodiversité et changement climatique
III- Comment répondre aux changements globaux : adaptation et actions

Cette unité d’enseignement transversale vise à donner à tout étudiant de 1er cycle de l’université Paris Saclay des notions de bases sur les enjeux de la transition écologique à mener dans les décennies à venir pour dépasser les grandes crises environnementales, notamment concernant le changement climatique et l’érosion de la biodiversité.

Objectifs de l’UE : Études des Sciences en Sociétés (sur différentes périodes/ dans différentes aires culturelles)
  
 Résumé : Cette UE, sous un format cours / TD, propose l’étude du dossier « le travail de la preuve » qui permet de travailler dans différents contextes (disciplinaires, culturels…) et périodes historiques :
 1° Comment la(les) preuve(s) est(sont) présentée(s), reprise(s, contestée(s), retravaillée(s), réécrite(s).
 2° Comment la(les) preuve(s) est(sont) reçue(s), comment les arguments sont jugés convaincants ou non, comment les critères de la preuve sont jugés pertinents ou non, comment la(les) preuve(s) est(sont) acceptée(s) ou rejetée(s) par une communauté scientifique, ou dans un contexte social plus large.
 3° L’existence de normes de preuves différentes.
 4° Comment des problèmes et questions posés sont considérés comme scientifiques ou non ; comme centraux ou secondaires. Quelles conséquences sur la portée d’une preuve au sein d’une communauté scientifique, ou dans un contexte social plus large ?

Compétences :

- Apprendre à lire des textes en relevant leur structuration et leur argumentation.
-Travailler sur des notions et les comprendre.
- Enrichir son vocabulaire.
- Susciter la réflexion sur des questions scientifiques à fort enjeux sociétaux.
- Développer un sens critique.
- Travailler en équipe, préparer un exposé.
- Travailler de manière individuelle.
- Travailler des compétences professionnelles (qualités de synthèse et d’argumentation, etc…).

L'UE est organisée en 8 créneaux de 3h, alternant des séances avec un enseignant et des séances de travail en autonomie.
 Un dossier sur « Le travail de la preuve » est fourni aux étudiants. Il s'agit de travailler d'abord les textes de manière autonome en suivant une grille de lecture fournie par l'enseignant, puis de les présenter oralement, de les discuter et de les remettre en perspective lors du cours-TD. L’enjeu est de faire travailler les processus de construction et de validation des savoirs scientifiques en allant au-delà d’un idéal de faits et de preuves - univoques, sans ambiguïté et immuables - qui s’imposeraient d’eux-mêmes.
 Au fil des séances, les étudiants acquièrent une perspective d'ensemble autour de problématiques diverses qu'ils apprennent ensuite à présenter de manière synthétique dans une note de synthèse.

Cours de présentation des terrains de stages
TD de constructions de lettres de motivations et CVs
Stage de 6 semaines minimum en milieu professionnel ou en laboratoire

Formation par l'activité professionnelle ou par la recherche
Participation à un travail de recherche ou professionnel (ne peut être limité à de l’observation)
Travail bibliographique
Rédaction de rapports
Préparation d'une présentation

Cours de présentation des terrains de stages
TD de constructions de lettres de motivations et CVs
suivi par un enseignant référent de la formation pendant le stage

La formation a pour objectif une initiation à la pédagogie et une confrontation à la réalité des métiers de l’enseignement. Elle comporte des cours, des TD d’accompagnement, deux stages en établissement, et un travail d’analyse autour de ces stages. Les deux stages peuvent se faire dans l’enseignement primaire ou dans l’enseignement secondaire. Ils sont réalisés en binôme, dans des établissements trouvés par les étudiants, en accord avec les responsables de l’UE. Les cours proposés portent sur : les démarches classiques d’enseignement et quelques démarches innovantes, les différents types d’objectifs d’apprentissage, les outils et supports pour enseigner, les compétences attendues des enseignants, les bases de la psychologie de l’apprentissage. Une partie complémentaire porte sur le décodage de l’institution scolaire, ses acteurs, ses valeurs et ses enjeux en utilisant l’histoire comme outil de contraste révélateur du présent. Les contenus des cours sont mis en application tout d’abord par l’analyse des séances observées en établissement. Ces analyses, accompagnées par des TD de suivi, font l’objet d’un travail mené pour partie en en binôme, qui aboutit à la rédaction d’un rapport de stage. Deuxièmement, une réflexion individuelle sur le métier, outillée par les éléments vus en cours et par les observations en établissement, et accompagnée par un enseignant universitaire tuteur, donne lieu à une synthèse écrite et une présentation orale

1 : Maîtriser des connaissances de base sur les difficultés d’apprentissage (Décrire les concepts de base de la psychologie de l'apprentissage).
2 : Analyser des situations d’apprentissage en référence aux principales conceptions pédagogiques (niv1 :Identifier une démarche d’enseignement)
3 : Etre conscient des enjeux et valeurs portés par l'institution et du positionnement des acteurs (niv1 : connaitre les grands axes des compétences attendues des enseignants, connaître les bases de l’histoire du système éducatif
4 : Communiquer de façon claire et rigoureuse à l’écrit comme à l’oral en français.
5 : Identifier des engagements réalistes dans le temps imparti et s’y tenir
6 : Travailler de façon autonome et en équipe de façon responsable

Cette UE comporte : 1) une séance débat de confrontation des représentations de l’enseignement et des souhaits d’expérience professionnelle, 2) la recherche en binôme, avec une ou deux personnes ayant des objectifs compatibles, de 2 lieux de stage et l’établissement de conventions de stage (en autonomie), 3) des cours de pédagogie et d’histoire des sciences faisant l’objet d’un contrôle continu, 4) l’observation et éventuellement la contribution à des séances d’enseignement en établissement (2x 2 semaines de stage en établissement) en alternance avec des séances d’analyse et prise de recul à l’université, 5) complément de formation sous forme d’une journée thématique impliquant des enseignants en poste (Journée Lycée-Université ou similaire), 6) la rédaction d’un rapport factuel en binôme et d’une synthèse réflexive individuelle soutenue par des séances de TP à l'université, 7)la soutenance orale de la synthèse réflexive, 8) une séance bilan sur le projet professionnel et les acquis des étudiants

BUCHETON Dominique. « Des gestes professionnels plus ajustés » (23 Novembre 2015). Vidéo.https://www.youtube.com/watch?v=CUwV05dFAHg.
 CONSEIL SCIENTIFIQUE de l'éducation nationale (sous la direction de Stanislas DEHAENE) La science au service de l'école (2019). Essai. Edition : Odile Jacob.
 DESSUS Philippe. Ressources de cours en sciences de l’éducation. Site web. http://espe-rtd-reflexpro.u-ga.fr/docs/sciedu-general/fr/latest/.
 DURU-BELLAT Marie. « Bistrot pédagogique sur les inégalités sociales à l’école » (25 novembre 2017). Vidéo.https://www.youtube.com/watch?v=JmVrvLg070o
 MINISTERE DE L’EDUCATION NATIONALE. « Programmes, ressources et évaluations » (mis à jour 7 novembre2020). Site web. https://eduscol.education.fr/pid23199/programmes-ressources-et-evaluations.html
 MINISTERE DE L’EDUCATION NATIONALE. « Référentiel des compétences des métiers du professorat et de l’éducation » (mis à jour Février 2020). https://www.education.gouv.fr/le-referentiel-de-competences-des-metiers-du-professorat-et-de-l-education-5753
 MONKA Yvan. « Découvre mon métier : prof » (11 novembre 2018). Vidéo. https://www.youtube.com/watch?v=hoo1iT11Z4g
 PALY Pascale. « Préparer une séquence et une séance d’apprentissage » (20 juin 2010). Page web.http://mp1d.ac-besancon.fr:1096/spip.php?article130
 PENNAC Daniel. Chagrin d'école (2007). Roman. Edition : Gallimard.
 PISA. « Compare your contry » (2018). http://www.compareyourcountry.org/pisa?utmsource=Adestra&utmmedium=email&utm_content=Compare%20your%20country:%20PISA
 STAR. « Enseignement explicite d’une stratégie de lecture » (5 aout 2015). Vidéo. https://www.youtube.com/watch?v=MWLimgMo3-s

Attendus de l'UE Langue-Anglais2 : Niveau B1 minimum dans les 5 compétences linguistiques

ANGLAIS GÉNÉRAL. Cette UE s'inscrit dans la continuité de l'UE Langue-Anglais1 : on prolongera notamment le
travail sur la prononciation ainsi que l'approche actionnelle dans les 5 compétences (compréhension
orale et écrite, expression écrite, expression orale en continu et en interaction) à partir de thèmes choisis tels que Science et Technologie, Médias et Réseaux sociaux.
L'interaction se fait à travers des documents écrits et/ou audiovisuels centrés sur une problématique et un scénario de
communication et/ou dans la cadre d'un projet tout au long du semestre. La communication interculturelle pourra être abordée dans le cadre du cours.

Le travail se fera par groupes de niveau.

L’objectif général du cours est de donner une base bien établie en Biochimie des protéines et Métabolisme énergétique.

Pour la première partie, le but sera d’acquérir des connaissances précises sur ce que sont les protéines et leur importance en biologie. Le cours décrit, de façon précise, les différents niveaux de leur organisation structurale avec l’idée d’unifier l’extraordinaire diversité des organisations macromoléculaires rencontrée en biologie par la combinaison de quelques principes sous-jacents.
Dans la seconde partie de cet enseignement, le but sera de comprendre les principes qui régissent les conversions d’énergie dans la cellule. En particulier, le cours se focalisera sur les mécanismes permettant à des organismes hétérotrophes d’oxyder les nutriments pour assurer la synthèse d’ATP.
Les travaux dirigés sont conçus pour apprendre aux étudiants à savoir regarder et se repérer dans une structure de protéine, y compris en utilisant des outils de bioinformatique structurale, et également à manipuler les concepts acquis sur les propriétés physico-chimique des protéines grâce à des exercices concrets. Ils leur permettront également de manipuler les concepts acquis sur les conversions d’énergie grâce à des exercices concrets.

L'esprit de cette unité d'enseignement est de se focaliser sur un éventail restreint de questions, choisies parce qu'elles sont une base utile à l'ensemble de la Biologie, mais de les couvrir avec une certaine exigence.

OAV1. Décrire la structure des protéines à différents niveaux (primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire) en s’appuyant sur les propriétés de la liaison peptidique et des chaînes latérales des acides aminés.
OAV2. Décrire les principes des méthodes utilisées pour comparer les séquences et les structures des protéines. Expliciter les conséquences des liens évolutifs.
OAV3. Décrire la succession des étapes nécessaire à l'obtention d'une protéine recombinante.
OAV4. Décrire les méthodes usuelles de purification préparative des protéines.
OAV5. Connaitre les principales méthodes d'analyse des protéines (SDS PAGE, western blot, séquençage). Interpréter les résultats d'expériences simples.
OAV6. Formuler et discuter les principes de bases de la Bioénergétique cellulaire.
OAV7. Reconnaitre, décrire et représenter les sucres simples et les principaux polysaccharides de réserve et de structure.
OAV8. Nommer, définir et exposer les voies métaboliques impliquées dans la synthèse de ATP cellulaire à partir de l’oxydation des sucres et des lipides simples.
OAV9. Décrire, représenter, expliquer et exposer l'ensemble des éléments impliqués dans le processus de phosphorylation oxydative.

Deux cours par semaine de 1h30 en Amphi : 1 sur les protéines et l'autre sur le métabolisme énergétique.
11 TD de 2h permettront d'approfondir les notions vues en cours et parfois d'aller plus loin dans certains domaines.

Un partiel est organisé en milieu de semestre (QCM) et un examen final a lieu généralement avant les vacances de Noel.

"Principes de Biochimie" de Lehninger

• "Biochimie" de Stryer, Berg et Tymoczko

Chimie de la L1 parcours BCST ou MPC

Première partie : Notions en réactivité chimique
-        Dessiner un diagramme énergétique pour une réaction endothermique ou exothermique
-        Expliciter la notion d’énergie d’activation d’une réaction chimique
-        Différencier un intermédiaire réactionnel et un état de transition 
-        Identifier les différents intermédiaires réactionnels

Deuxième partie : Réactivité des dérivés halogénés
-        Donner le nom et les propriétés physico-chimiques des dérivés halogénés
-        Décrire la réactivité d’un dérivé halogéné dans une réaction de Substitution Nucléophile d’ordre 1 et 2 sur le plan mécanistique, cinétique et stéréochimique
-        Décrire la réactivité d’un dérivé halogéné dans une réaction d’Élimination d’ordre 1 et 2 sur le plan mécanistique, cinétique et stéréochimique
-        Anticiper une compétition entre une réactivité d’ordre 1 et d’ordre 2 pour une Substitution Nucléophile et une Élimination
-        Anticiper une compétition entre des réactions de Substitution Nucléophile et d’Élimination
-        Détailler la synthèse et les propriétés physico-chimiques des organométalliques (organolithiens et organomagnésiens)

Troisième partie : Réactivité des dérivés carbonylés : aldéhydes et cétones
-        Donner le nom et les propriétés physico-chimiques des dérivés carbonylés
-        Identifier les principales réactivités des dérivés carbonylés (addition, oxydation, réduction et réactivités des énolates)
-        Décrire la réaction d’addition de divers nucléophiles sur un dérivé carbonylé
-        Anticiper les produits issus d’une réaction d’oxydation et de réduction des dérivés carbonylés

Quatrième partie : Synthèse et réactivité des alcools
-        Donner le nom, la classe et les propriétés physico-chimiques des alcools
-        Décrire la synthèse des alcools à partir de dérivés halogénés et carbonylés
-        Détailler les différentes réactivités des alcools

Cinquième partie : Pratique de laboratoire
-        Choisir la verrerie et suivre un protocole expérimental établi
-        Mettre en place des réactions chimiques basées sur des réactivités connues
-        Apprendre le fonctionnement de matériels courants de laboratoire
-        Rédiger un compte rendu de travaux pratiques

- Dessiner un diagramme énergétique détaillé d’une transformation chimique en y incluant les intermédiaires et les états de transition
- Détailler les réactions de Substitution Nucléophile (SN) et d’Elimination (E) d’ordre 1 et 2 de dérivés halogénés et alcools
- Prédire l’ordre 1 et 2 pour les réactions de Substitution et d’Elimination et anticiper les compétitions SN vs. E
- Décrire la préparation des dérivés carbonylés et exposer la réactivité des aldéhydes et cétones vis-à-vis de divers nucléophiles ; d’oxydants et de réducteurs 
- Réaliser une synthèse chimique basée sur une réactivité connue en suivant un protocole expérimental établi

Enseignements avec cours magistraux, travaux dirigés, travaux pratiques et mise à disposition d’éléments pédagogiques numériques : documents de cours et TD, annales et corrigés, FlashCards de révision (application dédiée sur téléphone), tests en ligne.
Interrogations en TD, partiel et examen final

« Chimie Organique », N. Rabasso, De Boeck.
« Chimie Organique », J. Clayden, N. Greeves, S. Warren, P. Wothers, Oxford.
« Traité de Chimie Organique », P. Vollhardt et N. Schore, De Boeck.
« Chimie Organique : Tout le cours en fiches », J. Maddaluno, V. Bellosta, I. Chataigner, F. Couty, L. Garcia, A. Harrison-Marchand, M.-C. Lasne, C. Lopin-Bon, J. Rouden, Dunod

• Connaitre la structure du noyau, 
   - Savoir écrire une configuration électronique, 
   - connaitre les règles de remplissages des OA, 
  - connaitre les structures de Lewis, 
  -  savoir faire une étude de fonction,
  -  connaitre les fonctions de base en mathématique (exponentielle, cosinus, sinus...)
   - savoir faire un diagramme de niveaux d’énergie des électrons dans les atomes hydrogénoïdes et placer des niveaux d’énergie

I. Structure électronique des atomes
  1. Notions de chimie quantique : approximation de Born-Oppenheimer, équation de Schrödinger et fonctions d'onde électroniques, densité de probabilité, surfaces nodales
  2. Orbitales atomiques : atomes hydrogénoïdes et polyélectroniques via le modèle de Slater
II. Structure électronique des molécules
  1. Construction d'orbitales moléculaires
  méthode CLOA, application aux diatomiques homo- et hétéro-nucléaires, interactions à 2 et 3 OA, lien avec la théorie de Lewis
  2. Méthode des fragments
  construction du diagramme d'OM de petites molécules, comparaison de géométrie, règle de la HO, séparation des systèmes sigma et pi, nucléophilie et électrophilie, diagramme de corrélation
  3. spectroscopies et dissociations de petites molécules

• représenter les OA s,p,d (taille, direction, surfaces…)
• savoir établir l'écriture mathématique de fonctions d'onde
• identifier les propriétés de symétrie des OA/OM
• appliquer un modèle simple (type Slater) pour déterminer les énergies des OA d’un atome polyélectronique
• établir le diagramme d'OM de molécules simples
• analyser un diagramme d'OM « quelconque », identifier les OA et les OM 
• faire le lien entre un diagramme d'OM et une structure de Lewis
• déduire des propriétés physico-chimiques à partir d'un diagramme d'OM : polarité, caractère acide/base de Lewis, spectroscopie et états électroniques
• prédire la réactivité électrophile/nucléophile par l’observation de la HO et de la BV

Les cours seront magistraux, les travaux dirigés (TD) ainsi que les travaux pratiques (TP) auront lieu en petits groupes. Les TP se dérouleront en salle informatique.
Un accompagnement sous forme de petits exercices ou de QCM en ligne sera proposé avant chaque TD et en début de chaque cours pour mettre l’accent sur des points précis. Un TP en autonomie sera proposé pour la visualisation des OA.
L’UE sera évaluée grâce à une note d'exercice numérique continu, un compte-rendu de TP, un partiel et un examen.

• Structure électronique des molécules (tomes 1 et 2), Y. Jean et F. Volatron (Dunod)
 • Les cours de Paul Arnaud - Chimie Générale (7ème édition du cours de Chimie Physique), P. Arnaud, F. Rouquérol, G. Chambaud, R. Lissillour, A. Boucekkine, R. Bouchet, F. Boulc'h, V. Hornebecq (Dunod)
 • Chimie physique, P-W Atkins et Julio de Paula (de Boeck)
 • Traité de Chimie Organique, P. Vollhardt et N. Schore (de Boeck)

Chimie de la L1 parcours BCST ou MPC

Définition d’un complexe et nature de l’interaction métal-ligand
  Le métal de transition : situation dans le tableau périodique, potentiel d’ionisation, description des orbitales d, énergie des orbitales de valence, configuration électronique
  Description des ligands : denticité, hapticité,…
  Description des complexes : Géométrie, décompte électronique, nomenclature, équilibre de complexation (constante de formation, effet chélate)
  Structure électronique des complexes dans le cadre du modèle de champ cristallin (symétrie octaédrique, tétraédrique, plan carré, effet Jahn-Teller, champ fort - champ faible, série spectrochimique)
Application du modèle du champ cristallin : explication de la couleur et des propriétés magnétiques de systèmes dilués (diamagnétisme, paramagnétisme)

Savoir décrire un complexe d’un métal de transition (savoir le représenter, le nommer et effectuer le décompte électronique des orbitales de valence)
Savoir représenter les orbitales d et trouver leur levée de dégénérescence dans différentes géométries dans le cadre du modèle de champ cristallin
Savoir interpréter le champ de ligand en fonction de la nature du métal et du ligand
Savoir exploiter la configuration électronique pour comprendre des données spectroscopiques simples ( absorption UV-visible , moment magnétique)

Enseignements avec cours magistraux et  travaux dirigés. Evaluation par 1 partiel et 1 examen terminal.

Chimie³ : introductiockn à la chimie inorganique, organique et à la chimie physique / Burrows, Holman, Parsons...et al. ; Ed. De Boeck

Chimie inorganique , Housecroft, Sharpe ; Ed De Boeck

Pré-requis : Bases de biologie moléculaire et de génétique de L1 (réplication, transcription, traduction, mitose et méiose). Bases de la démarche scientifique et techniques expérimentales vues en L1.

Le contenu réparti dans deux UEs sur les 2 semestres GBM1 (L2S3) et GBM2 (L2S4) vise à permettre aux étudiants 1) d’intégrer les connaissances actuelles sur les mécanismes de transmission de l’information génétique tant par des approches génétiques que par des approches de biologie moléculaire, à la fois chez les procaryotes et les eucaryotes ; 2) d’intégrer les principaux concepts qui président à la stabilité et l’évolution des génomes ; 3) d’intégrer les différentes techniques de biologie moléculaire ainsi que les approches génétiques mises en œuvre pour étudier l’ensemble de ces mécanismes.

À l’issue de cet enseignement, les étudiants seront en mesure :
OAV 1 : d’intégrer le mécanisme de réplication de l’ADN chez les procaryotes. Il/elle saura restituer l’enchainement des étapes à l’échelle de la cellule en associant réplication et division cellulaire.  
OAV 2 : de définir les grandes classes de lésions de l'ADN, et de décrire les principaux mécanismes de réparation de ces lésions, de distinguer lésion et mutation, de définir le polymorphisme présent au sein d’une population.  
OAV 3 : d’intégrer les notions de base de la génétique mendélienne: l'étudiant-e devra être capable de décrire les étapes de mitose et de meïose, de prédire le devenir d'un et de deux couples d'allèles à travers la reproduction sexuée; D'illustrer l'effet des stress génotoxiques sur la variabilité génétique.  
OAV 4 : de calculer le titre d’une culture bactérienne, de déterminer un pourcentage de survie et une fréquence de mutation, de réaliser et d’analyser des tests génétiques (dominance/récessivité) chez la levure.  
OAV 5 : d’identifier le ou les gènes impliqué(s) dans un processus biologique par le test de complémentation fonctionnelle.  
OAV 6 : de décrire les techniques expérimentales de biologie moléculaire (but, principe et limites), d’appliquer la démarche scientifique : analyser et interpréter les résultats expérimentaux, formuler à partir de ces données des conclusions ou des hypothèses.   
OAV 7 : de mettre en œuvre un protocole expérimental incluant des approches génétiques, de biologie moléculaire et de microbiologie en respectant les règles de sécurité en laboratoire.

Cette UE est organisée comme suit : 8 cours de 2H (un par semaine), 10 TD de 2H (un par semaine) et également 2 séries de TP. Un partiel est organisé en milieu de semestre et un examen final a lieu généralement avant les vacances de Noël. L’UE bénéficie d’un cours eCampus structuré incluant l'ensemble des powerpoints des enseignements, le poly de TD incluant des bulles d'aides pour faciliter la préparation des TD avant les séances, ainsi que des fiches méthodologiques, un glossaire, et des exercices et problèmes corrigés sur certaines parties de cours pour aider les étudiants à la compréhension des notions enseignées. Enfin le dernier TD est une annale d'un examen posé une des années précédentes permettant aux étudiants de se préparer à l'examen écrit final du mois de décembre.

Biologie moléculaire de la cellule. B. Alberts, et al.
Génétique, gènes et génomes Rossignol, J.L. et al.
Génétique. Serre J.L.

-Nomenclature et connaissance des fonctions chimiques de base ; 
-Représentation des molécules (semi-développée, topologique, Newman) ; 
-Calcul du nombre d’insaturations ; 
-Connaissance des effet électroniques (inductifs et mésomères) ; 
-Notions sur les forces intermoléculaires; 
-Connaissance du spectre électromagnétique

-Chromatographie : principe générale de la séparation, introductions aux différents types de chromatographie, conditions d'optimisation de la séparation. 
-Spectroscopie IR : modèle de l'oscillateur harmonique, description des modes de vibration, analyses de spectres en transmittance, utilisation de tables de données.
-Spectroscopie RMN 1H : bases du phénomène RMN, évaluation du spin, effet Zeeman, fréquence de résonance, interaction d'écran électronique, définition de l'échelle de déplacement chimique, interaction de couplage scalaire, équivalence chimique et magnétique, analyses de spectres du 1er ordre simples, utilisation des tables de données RMN 1H. 
-Spectrométrie de Masse : principe général, applications exclusives en ionisation électronique, fragmentations des fonctions carbonyle, amine et éther-oxyde.

1. Chromatographie 
1.1. Principe général
1.2. Chromatographie en phase liquide
1.3. Chromatographie en phase gazeuse
1.4. Facteurs influençant l’élution des composés

2. Spectroscopie IR 
2.1. Modèle de l'oscillateur harmonique et fréquence de vibration
2.2. Facteurs influençant la fréquence de vibration 
2.3. Les modes de vibration
2.4. Interprétation des bandes par fonctions chimiques

3. Spectroscopie RMN proton
3.1. Principe général
3.2. Le déplacement chimique
3.3. Facteurs influençant le déplacement chimique
3.4. L’équivalence chimique
3.5. L’intégration du signal RMN
3.6. Le couplage scalaire avec des noyaux magnétiquement équivalents
3.7. Cas des protons échangeables

4. Spectrométrie de masse
4.1. Définitions des différentes masses
4.2. Présentation générale de la SM par impact électronique
4.3.  Mécanismes de fragmentation en impact électronique

Travail expérimental :
TP Infra-rouge : Echantillonnage de plusieurs produits et enregistrement de leur spectre - Identification de ces produits.
TP Chromatographie en phase gazeuse : Détermination de la composition d’un mélange grâce à deux types de colonnes de polarité différentes.

• Savoir décrire les principes de base de techniques d’analyse et de séparation couramment utilisées en laboratoire (chromatographie, spectroscopie infrarouge (IR), spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) et spectrométrie de masse (SM))
• Savoir extraire les données pertinentes d’un spectre ou d’un chromatogramme
• Interpréter les données spectrales en informations structurales 
• Croiser des données issues de différentes spectroscopies pour élucider la structure moléculaire fine d’un composé

Enseignements avec cours magistraux, travaux dirigés et travaux pratiques. Mise à disposition des éléments pédagogiques en ligne: table de données, fascicules de TD et de TP. Exercices supplémentaires et annales d'examen avec corrections, 
Mise en pratique, lors de TP, de concepts en chromatographie et spectroscopie IR.

Chimie de la L1 parcours BCST ou PCST, Chimie de la L1 DDPC ou DDCSV. 
 Chimie du S3 de la L2 Chimie ou iBC ou chimie du S3 de la L2 DDPC ou DDCSV

Première partie : Synthèse et réactivité des alcènes
 - Donner le nom, les propriétés physico-chimiques et spectroscopiques des alcènes
 - Donner les préparations des alcènes par hydrogénation contrôlée des alcynes, élimination d’ordre 1 et 2 avec définition des notions de stabilité des carbocations, d’hyperconjugaison et énoncer des règles de Zaïtsev et par allongement des chaînes carbonées.
 - Détailler la réactivité des alcènes et leur conséquence stéréochimique : définition des additions stéréospécifiques, non stéréospécifiques, régiosélectives – énoncé des règles de Markovnikov. Pour illustrer ces notions, des exemples de réaction (Dihydrogénation, Dihydroxylation, Hydroboration, Addition d’acides hypohalogéneux, d’acides halohydriques, iodolactonisation, addition d’eau et d’alcool en milieu acide) seront abordés.
 - Décrire les réactions de coupures oxydantes des alcènes, de cyclopropanation.
 - Aborder des notions de polymérisations cationiques, de réactions radicalaires - définition de l’effet Kharash.
 
 Deuxième partie : Synthèse et réactivité du benzène et des composés aromatiques
 - Expliciter et définir les règles régissant l’aromaticité (Hückel)
 - Donner les généralités sur les composés aromatiques, les nommer.
 - Réactivité du benzène : détailler des intermédiaires de Wheland, leur stabilité, les effets Activation/Désactivation des substituants du benzène sur l’orientation (Règles de Holleman)
 - Décrire les principales réactions de Substitutions Electrophiles Aromatiques (SEAr) : Halogénation, Alkylation et acylation (Friedel et Crafts), Nitration et sulfonation.
 
 Troisième partie : Synthèse et réactivité des acides carboxyliques
 - Donner le nom, les propriétés physico-chimiques et spectroscopiques des acides carboxyliques
 - Préparation des acides carboxyliques à partir de précurseurs carbonylés, addition de réactifs de Grignard sur le dioxyde de carbone, par hydrolyse de nitrile.
 - Détailler les différentes réactivités des acides carboxyliques pour la formation d’esters, d’amides, de chlorure d’acide et leur réduction par des hydrures.
 
 Quatrième partie : Pratique de laboratoire
 - Mettre en place des réactions chimiques basées sur des réactivités connues.
 - Effectuer une synthèse multi étape d’un composé cible.
 - Rédiger un compte rendu de travaux pratiques.

OAV 1 : Décrire la synthèse et la réactivité des alcènes
OAV 2 : Décrire la réactivité du benzène et des composés aromatiques
OAV 3 : Décrire la synthèse et la réactivité des acides carboxyliques
OAV 4 : Réaliser une synthèse chimique en suivant un protocole expérimental établi

Enseignements avec cours magistraux, travaux dirigés, travaux pratiques et mise à disposition d’éléments pédagogiques numériques (documents de cours et TD, annales et corrigés, tests en ligne).
  Interrogations en TD, partiel, examen.

« Chimie Organique », N. Rabasso, De Boeck.
  « Chimie Organique », J. Clayden, N. Greeves, S. Warren, P. Wothers, Oxford.
  « Traité de Chimie Organique », P. Vollhardt et N. Schore, De Boeck.
  « Chimie Organique : Tout le cours en fiches », J. Maddaluno, V. Bellosta, I. Chataigner, F. Couty, L. Garcia, A. Harrison-Marchand, M.-C. Lasne, C. Lopin-Bon, J. Rouden, Dunod

Bases de biologie moléculaire et de génétique de L1: transcription et traduction. Bases de la démarche scientifique, techniques expérimentales vues en L1 et L2 S3.

L’UE GBM2 vise à permettre aux étudiants 1) d’intégrer les connaissances actuelles sur certains mécanismes de transmission de l’information génétique tant par des approches génétiques que par des approches de biologie moléculaire, majoritairement chez les procaryotes , parfois chez les eucaryotes ; 2) d’intégrer les principaux mécanismes qui président à la stabilité et l’évolution des génomes ; 3) d’intégrer différentes techniques de biologie moléculaire ainsi que les approches génétiques mises en œuvre pour étudier l’ensemble de ces mécanismes.

À l’issue de cet enseignement, les étudiants seront en mesure de :
OAV1 : Savoir prédire le devenir d’un allèle lors de la parasexualité bactérienne : transformation, conjugaison.
OAV2 : Comprendre les principes de la PCR, concevoir des amorces de PCR et les contraintes liées au design d’amorces.
OAV3 : Comprendre les étapes clés d’un clonage moléculaire (digestion, ligature, transformation), choisir les enzymes de restriction et vecteurs appropriés selon le but expérimental, et interpréter les résultats d’un clonage (gel d’agarose, séquence, orientation de l’insert).
OAV4 : Décrire et distinguer les différentes étapes de la transcription (initiation, élongation et terminaison) chez les procaryotes et les eucaryotes.
OAV5 : Expliquer les principes généraux de la régulation transcriptionnelle chez les bactéries (répresseur, activateur, opéron) et décrire les modèles de régulation positive et négative.
OAV6 : Comprendre la complexité de la régulation transcriptionnelle chez les eucaryotes, identifier les rôles des séquences régulatrices et décrire les différents mécanismes de régulation transcriptionnelle et/ou post-transcriptionnelle en incluant ceux impliqués dans l’initiation de la transcription, la stabilité des ARNm et l’épissage.
OAV7 : Décrire les mécanismes impliqués dans les différentes étapes de la traduction (initiation, élongation et terminaison) chez les eucaryotes et chez les procaryotes. 
OAV8 : Décrire la structure des gènes et des génomes chez les eucaryotes et chez les procaryotes. 

OAV9 : Identifier le rôle des ARNt et des ribosomes et comprendre la notion de code génétique.

OAV10 : Décrire les effets des mutations lorsqu’elles sont positionnées sur le promoteur des gènes ou ses séquences de régulation localisées en cis, dans la séquence codante, à la jonction intron-exon et dans les régions intergéniques. 

OAV11 : Décrire les techniques expérimentales de biologie moléculaire (but, principe, limites et contrôles) et appliquer la démarche scientifique : analyser et interpréter les résultats expérimentaux, formuler à partir de ces données des conclusions ou des hypothèses.

Cette UE comprend 9 cours magistraux de 2H dispensés au rythme d’un par semaine.  11 TD de 2H chacun viennent illustrer les CM et leur sont complémentaires puisqu’ils permettent un approfondissement de certaines notions abordés en cours. Le dernier TD se présente sous forme d’une annale d'un examen posé les années précédentes permettant aux étudiants de se préparer à l'examen écrit final. De plus, 5h de TP permettent de mettre en pratique le concept de PCR à travers la caractérisation de mutants. L’UE bénéficie d’un cours eCampus structuré incluant l'ensemble des powerpoints des enseignements, le poly de TD incluant des bulles d'aides pour faciliter la préparation des exercices avant les séances, ainsi que des fiches méthodologiques. L’acquisition des notions sera évaluée d’une part en contrôle continu à travers un examen sur table en milieu de semestre et un compte-rendu de TP effectué en binôme / trinôme, et d’autre part par un examen écrit final.

- Biologie moléculaire de la cellule. B. Alberts, et al.          - - - Raven, Johnson, Mason, Losos, Singer - Sciences du vivant
Adaptation française sous la direction de Jean-Claude Planel- Éditions De Boeck Supérieur, 6ᵉ édition (2020)
ISBN : 978-2-8073-2949-5

Premier et second principe de la thermodynamique et application aux réactions chimiques
 1. UE de l’atome à la matière (chimie 1) du L1 S1 BCST
 2. UE Transformations et propriétés de la matière (Chimie 2) du L1 S2 BCST
 3. UE Mathématiques du L1 S1 BCST

Introduction de l’enthalpie libre - Enthalpie libre de réaction - Variation avec la température et cycle de Hess avec changement d’état ; Introduction du potentiel chimique ;
  Equilibre chimique – Principe de modération de Le Châtelier – Déplacement d’équilibre : influence de la température, de la pression, de la composition du système ;
  Application aux équilibres homogènes en phase gaz, aux équilibres hétérogènes et équilibres acide-base.

Acquisition des compétences nécessaires en thermodynamique pour l’étude des équilibres chimiques.

Enseignement avec cours magistraux, TD et mise à disposition d’éléments pédagogiques numériques (documents de cours, TD) ; QCM et interrogation écrite via WIMS et/ou e-campus.

1. Thermodynamique et équilibres chimiques par Alain Gruger aux éditions Dunod
 2. Thermodynamique dans la collection les nouveaux précis Bréal par Jean-Louis Queyrel aux éditions Bréal
 3. Thermodynamique et cinétique chimiques, équilibres chimiques en solution aqueuse dans la collection les nouveaux précis Bréal par Jacques Mesplède aux éditions Bréal
 4. Thermodynamique par Hubert Lumbroso aux éditions Ediscience International

Programme de L1 : 
- Composition, fonction et interactions des différents compartiments cellulaires
- Cytosquelette et mitose
- Développement embryonnaire précoce du Xénope
- Organisation d’une plante à fleurs et développement primaire
Programme de L2S3 (UE GBM1 et Biochimie) :
- Expression de l’information génétique 
- Structure des protéines à différents niveaux
- Techniques expérimentales de biologie moléculaire

Cette UE pluridisciplinaire vise à fournir les notions indispensables pour comprendre :
 (i) la façon dont les comportements cellulaires (division, différenciation, croissance/élongation, migration) façonnent l’organisme en développement au cours du temps et dans les 3 dimensions de l’espace ;
 (ii) les spécificités du développement végétal (stratégie d'adaptation à l'environnement et à ses contraintes) ;
 (iii) l’importance de la communication et des interactions entre cellules/tissus pour le développement harmonieux de l'organisme.
 
Programme : Les cours magistraux (20h) permettront dans un premier temps d’introduire les principes de la signalisation cellulaire et d’étudier à l’échelle moléculaire les processus de division et de migration cellulaires. Ces apprentissages seront ensuite exploités dans le contexte de l’organisme animal ou végétal en développement dans le but d’illustrer comment prolifération, spécialisation cellulaire, changements de forme, croissance, processus migratoires (chez les animaux) et communications intercellulaires contribuent à façonner le futur individu. Une ouverture sera faite sur les pathologies associées à ces processus et la biologie des cellules souches.
Les travaux dirigés (15h) seront consacrés à observer, se questionner et mettre en œuvre les bases de la démarche scientifique. Un accent particulier sera mis sur la méthodologie de l’analyse de documents, la schématisation et la modélisation de résultats.
Les travaux pratiques (10h) permettront une initiation à la technique d’immunofluorescence et à la manipulation des fonctions de base d’un logiciel d’imagerie (ImageJ).

OAV1. Décrire l’organisation des cellules eucaryotes et leur environnement cellulaire
Il s’agit ici que l’étudiant (i) approfondisse les notions vues en L1 sur les organites intracellulaires et le cytosquelette et (ii) sache décrire et illustrer la structure de la matrice extracellulaire, les interactions cellules/matrice et les caractéristiques de la paroi des végétaux.
OAV2. Schématiser les différents modes de communication intercellulaire et leur impact sur l’activité biochimique, sur l’expression génique et sur l’organisation de la cellule cible (cytosquelette en particulier).
Il s’agit ici que l’étudiant soit capable de décrire les bases de la communication cellulaire (signal, récepteur membranaire, cascade intracellulaire, réponse biochimiques ou modification d’une combinatoire de facteurs de transcription spécifiques). Ces bases sont préalables à l’étude des comportements cellulaires in vivo (OAV6). Il n’est pas demandé de retenir la structure de voies de signalisation classiques ni de connaître les grandes familles de facteurs de transcription spécifiques.
OAV3. Décrire et schématiser les comportements cellulaires fondamentaux
Il s’agit ici que l’étudiant soit capable de décrire les comportements cellulaires universels qui sous-tendent le développement des organismes pluricellulaires : la division cellulaire (et l’influence de ses modalités sur le devenir des cellules), les étapes d’une voie de différenciation, l’expansion d’une cellule végétale, la transition épithélio-mésenchymateuse et la migration d’une cellule animale. D’un point de vue mécanistique, un focus est fait sur le rôle du cytosquelette au cours de la mitose animale et végétale et sur la régulation du cycle cellulaire (limité à la régulation de l’entrée en phase S). On introduit aussi la notion de programme génétique de différenciation.
OAV4. Décrire la formation/organisation et le devenir d’un nombre limité de structures embryonnaires ou post-embryonnaires
On souhaite ici que l’étudiant acquiert le vocabulaire de base préalable à la description de phénotypes in vivo et qu’il se familiarise avec les systèmes développementaux dans lesquels les processus cellulaires du développement seront étudiés. Il s’agit d’être capable de décrire un nombre limité de structures embryonnaires/post-embryonnaires (l’embryon d’angiosperme et le fonctionnement des méristèmes apicaux pour le développement végétal ; le développement précoce, les crêtes neurales et les somites pour le développement animal qui sera limité à des modèles vertébrés). L’étudiant doit aussi être capable de situer ces structures dans l’espace et le temps et de citer leur devenir.
OAV5 (transversal). Savoir décrire et/ou mettre en œuvre différentes techniques d’analyse couramment utilisées en Biologie cellulaire et Développement
L’enjeu ici est que l’étudiant soit capable de décrire, sans rentrer dans les détails moléculaires, le principe des techniques/outils d’analyse couramment utilisés en Biologie cellulaire et Développement. D’un point de vue pratique, l’étudiant apprendra à réaliser une immunofluorescence, manipuler les fonctions de base d’un logiciel de traitement d’image (IMAGEJ) et réaliser un montage.
OAV6 (transversal). Analyser des expériences in vitro ou in vivo et modéliser une procédure ou un résultat
Le but ici est que l’étudiant soit capable, sur la base des connaissances théoriques et techniques acquises (OAV 1 à 5), d’interpréter un panel d’expériences (au niveau cellulaire ou au niveau de l’organisme) ayant trait à un nombre limité de systèmes développementaux. Il lui est demandé de savoir décrire un phénotype, comparer contrôle et situation expérimentale et conclure sur la question biologique traitée. Si une modélisation du résultat est demandée, l’étudiant sera guidé pas à pas dans sa réalisation (par exemple via des schémas à compléter).

L’UE bénéficie d’un cours eCampus très structuré incluant : 
- Une proposition de planning de travail hebdomadaire afin de ne pas se laisser déborder. 
- Des synthèses rédigées reprenant à l’aide de vidéos ou schémas légendés les notions majeures abordés en cours d’amphi.
- Des quizz d’auto-évaluation sur chaque partie du programme.
Des séances de révisions en amphi sont en outre organisées avant les premières épreuves de contrôle continu.

Biologie cellulaire. Y. Bassaglia
Biologie moléculaire de la cellule. B. Alberts, et al.
Biologie du développement : Les grands principes. L.Wolpert et al.
Biologie Végétale Croissance et Développement. J.F. Morot-Gaudry, R. Prat & I. Bohn-Courseau

L1 Physique-Chimie-Biologie

1. Introduction et généralités sur les médicaments.
2. Le devenir des médicaments dans l'organisme.
3. Propriétés physico-chimiques des médicaments.
4. Pharmacomodulations chimiques pour optimiser les candidat médicaments.
5. Métabolisme et toxicité des médicaments.
6. Contrôle physico-chimique des médicaments.

Connaître les processus chimiques mis en œuvre au cours de la vie d'un médicament. Décrire les propriétés physico-chimiques spécifiques aux molécules à visée thérapeutiques. Etablir et utiliser les notions de pharmacomodulations. Connaitre et savoir appliquer les principaux mécanismes du métabolisme des médicaments. Appréhender les réactions chimiques mises en œuvre dans le contrôle des médicaments.

Enseignement de type classique avec cours magistraux (6*2h), travaux dirigés interactifs (wooclap) et en petits groupes de travail (2*2h), travaux pratiques sur le contrôle des médicaments (4h). Documents pédagogiques disponibles sur e-campus. Exercices complémentaires proposés sous diverses formes (WIMS et/ou e-campus). Compte-rendu de TP et Examen final.

G.L. Patrick, « An Introduction to Medicinal Chemistry », Oxford University Press
C. G. Wermuth, “The Practice of Medicinal Chemistry” - 4th Edition – 2015 - Academic Press

Fonctions usuelles. Dérivée et primitive de fonctions.

Equations différentielles linéaires du premier ordre. Méthode de variation de la constante. Equations différentielles à variables séparées
Calcul matriciel en dimension 2 ou 3, déterminant, systèmes linéaires, diagonalisation des matrices 2x2 et 3x3.
Systèmes différentiels linéaires de 2 équations à 2 inconnues.

Savoir résoudre les systèmes d'équations différentielles rencontrés en cinétique chimique.
Savoir maîtriser le calcul matriciel en dimension 2 ou 3
Savoir s’initier aux notions de valeur propre et de vecteur propre dans ce cadre

Cette UE est organisée autour de cours magistraux et de séances de TD centrés sur les équations différentielles et le calcul matriciel. Une version papier du livret d’exercices travaillés en TD est distribuée aux étudiants

Notions de base en mathématiques (trigonométrie, dérivation, etc.)
Physique de niveau L1 (optique géométrique, mécanique, etc.)

Cours : 
I Propagation d’une onde : généralités, équation d’onde, vitesses
II Les ondes stationnaires : superposition, réflexion, modes propres
III Les ondes sonores : intensité, transmission, effet Doppler
IV Les ondes lumineuses : onde électromagnétique, diffraction, interférences
Travaux dirigés : propagation d’un tsunami, génération d’un son par une corde vocale, écholocation par une chauve-souris, principe de l’échographie, iridescence du scarabée.
Travaux pratiques : propagation des ultrasons, modes de vibration d’une corde, diffraction par la molécule d’ADN.

Savoir utiliser des outils théoriques simples de la physique des ondes pour répondre à des problématiques biologiques.
Comprendre le rôle des ondes dans les processus de communication et d’exploration utilisés par le vivant.
Acquérir des connaissances sur le fonctionnement d’instruments d’étude et d’imagerie employés en biologie.
Mettre en pratique avec autonomie et initiatives des compétences expérimentales (réalisation de mesures, analyse de données).

4 séances de 2h de cours et 4 séances de 2h de TD, en alternance, complétées par 3 séances de 4h de TP.

Modalité de contrôle des connaissances en première session : une épreuve de contrôle continu de type interrogation écrite (15%), un examen écrit final de 2h (60%), trois comptes rendus de TP (25%).

Physique pour les sciences de la vie 1, 2, 3 (A Bouyssy, M Davier, B Gatty)
Physique (Kane & Sternheim)

Savoir tracer et lire un graphe.
Savoir déterminer le coefficient directeur d’une droite.
Maîtriser la résolution d’équations différentielles linéaires à coefficients constants.
Savoir établir un tableau d’avancement d’une réaction chimique.

Ce module vise à démythifier l’approche cinétique, en en présentant les fondements dans les domaines de la chimie et de la catalyse enzymatique. Les bases communes seront soulignées et les méthodes spécifiques à chacune des deux disciplines seront également abordées. Ce cours mettra l’accent sur la justification et les conséquences de toutes les simplifications mises en œuvre pour élaborer puis analyser un schéma cinétique élémentaire. La nécessité d’un aller-retour permanent entre schéma réactionnel et expérience sera soulignée.

Les cours magistraux (9h) et les TD (9h) aborderont les points suivants:
1. Fondements de la cinétique chimique

Vitesse et ordre d'une réaction chimique
Réactions élémentaires, réactions globales
Influence de la température
Réactions réversibles
Catalyse

2. Cinétique enzymatique michaélienne

Définition et mesure d’une vitesse de réaction enzymatique
Hypothèses de l’état stationnaire et du quasi-équilibre
Etat stationnaire et préstationnaire
Efficacité catalytique. Constante de Michaelis et affinité
Courbe de progression d’une réaction : équation de Michaélis et Menten intégrée

7h de TP permettront à l'étudiant de s'approprier les notions de vitesse et d'ordre de réaction, d'illustrer le rôle de la température et d'une enzyme sur la vitesse d'une même réaction étudiée d'un point de vue chimique et biologique.

• Exprimer la vitesse d’une réaction chimique.
• Etablir et utiliser les lois de vitesse d’ordre simple.
• Extraire des paramètres cinétiques (vitesse, ordres, énergie d’activation) à partir de données expérimentales.
• Décrire le profil réactionnel d’une réaction complexe donnée.
• Distinguer explicitement les courbes donnant la cinétique de formation du produit et la vitesse initiale de la réaction en fonction de la concentration initiale en enzyme ou en substrat.
• Reconnaître, à partir des données cinétiques expérimentales, les caractéristiques reliées à l’équilibre et celles reliées à la vitesse de réaction.
• Décrire le principe de mesure d’une activité enzymatique.
• Utiliser des données expérimentales pour déterminer les paramètres cinétiques d'une réaction enzymatique.

Les enseignements se répartissent de la manière suivante :
- 9h de cours magistraux (4,5h en cinétique chimique et 4,5h en cinétique enzymatique)
- 9h de TD (4,5h en cinétique chimique et 4,5h en cinétique enzymatique)
- 7h de TP (3,5h en cinétique chimique et 3,5h en cinétique enzymatique)
Deux contrôles continus en distanciels sont prévus

F. Rouquérol, G. Chambaud, R. Lissillour, A. Boucekkine. (2013) Les cours de Paul Arnaud, 7ème édition du cours de chimie-physique, "Chimie Générale", Dunod.
Athel Cornish-Bowden (2012) Fundamentals of Enzyme Kinetics (4ème edition) Wiley–Blackwell.

L1 BCST (S2) : Transformation et propriétés de la matière (ou équivalent)
L2 iBC (S3) : Thermochimie et équilibres

1. Rappels
1.1 construction et utilisation des tableaux d’avancement
1.2 notion d’équilibre, constante d’équilibre, sens spontané d’évolution d’un système, notion d’électrolyte fort et d’électrolyte faible
1.3 différents types de réactions en solution

2. Equilibres acido-basiques
2.2 constante d’acidité, force relative des acides et des bases, échelle de pH
2.3 calculs de pH dans des cas simples (acide fort, base forte, acide faible, base faible, polyacides et polybases)
2.4 diagrammes de prédominance et distribution des espèces en fonction du pH
2.5 solutions tampons

3. Equilibres de complexation
3.1 réactions de complexation, constantes de formation et de dissociation, équilibres successifs
3.2 réactions d’échange de ligands, prévision du sens de réaction.
3.3 détermination de l’état d’équilibre d’un système siège de réactions de complexation, diagrammes de prédominances

4. Equilibres d’oxydo-réduction
4.1 Degré d’oxydation, couple oxydo-réducteur, demi-réactions et réactions redox
4.2 Relation de Nernst, lien avec la constante d’équilibre
4.3 Influence du pH ou de la complexation

5. Dosages 
5.1 Différents types de dosage (dosage direct, dosage en retour. Dosage acide-base, dosage redox, dosage complexométrique)
5.2 Détermination de l’équivalence (pHmétrie, potentiométrie, colorimétrie)
5.3 Exploitation d’une courbe de dosage, incertitude

TP
1. titrage simple : méthodologie, verrerie, colorimétrie
2. dosage potentiométrique

Savoir reconnaître et équilibrer les différents types de réactions en solution aqueuse (acide-base, complexation, oxydoréduction). Savoir construire et exploiter des tableaux d’avancement complexes.
Savoir déterminer le sens d’évolution spontanée et l’état d’équilibre final d’un système siège d’une réaction chimique à partir des données thermodynamiques.
Savoir construire et exploiter un diagramme de prédominance, d’existence ou de distribution des espèces en solution.
Savoir réaliser et interpréter de manière critique (incertitudes) un dosage en solution aqueuse par diverses méthodes.
Savoir interpréter une courbe de dosage pour déterminer expérimentalement une grandeur thermodynamique. Savoir modéliser une courbe de dosage simple.

Enseignement de type classique avec cours magistraux (6h), travaux dirigés (16h), travaux pratiques (7h). Documents pédagogiques disponibles sur e-campus. Exercices complémentaires proposés sous diverses formes (polycopiés, WIMS et/ou e-campus). contrôle continu, partiel, examen.

Chimie : BCPST-Véto 1re année. Grécias P., Rédoglia S., Tejedor V. Paris : Lavoisier Tec & Doc, 2017.
Chimie : BCPST-Véto 2ème année. Grécias P., Rédoglia S. Paris : Lavoisier Tec & Doc, 2017.
Chimie disséquée à l’usage des Bio : BCPST-Véto. Coiffier A., Verdier E., Brice-Profeta S. Ellipses Editions, 2004.